FC Zenit je jedini nogometni klub koji je vlasnik svih trofeja SSSR-a i Rusije. Ovu momčad nisu poštedjeli uspjesi u međunarodnoj areni - Zenit je postao vlasnik UEFA kupa i UEFA Superkupa u sezoni 2007/08.
Uspjesi na prvenstvima SSSR-a i Rusije
Prva veća pobjeda došla je do FC Zenita 1944. godine, kada je osvojio Kup SSSR-a. U finalu turnira poražen je moskovski CDKA rezultatom 2-1, a pehar je prvi put bio u posjedu momčadi Sankt Peterburga.
Nije bilo moguće razviti uspjeh, a sljedećih godina Zenit nije imao velike pobjede ni u kupu ni u prvenstvu, a 1967. momčad je bila na rubu ispadanja, ali odlučeno je da se proširi prvenstvo SSSR-a, i Zenit je zadržao registraciju.
Situacija se promijenila tek 1978. godine, kada je Jurij Morozov postao glavni trener FC Zenita. Tim iz Lenjingrada počeo je igrati napadačkiji nogomet, privlačiti vlastite učenike, a već 1980. godine osvojio je brončane medalje prvenstva SSSR-a, a 1984. godine Zenit, predvođen Pavelom Sadirinom, postao je pobjednik državnog prvenstva za prvi put u svojoj povijesti.
Nakon raspada Sovjetskog Saveza, Zenit je bio ozbiljno grozničav, a momčad iz grada na Nevi čak je nekoliko sezona morala provesti u odjelu niže klase. Povratak u elitu dogodio se 1995. godine, ali još je bio dug put do velikih pobjeda.
Tek 1999. FC Zenit je osvojio prvi trofej nakon povratka u najvišu ligu, Ruski kup, a dvije godine kasnije, 2001. godine, osvojene su brončane medalje ruskog prvenstva. No, sljedeća se sezona pokazala neuspjehom, a momčad je vodio češki stručnjak Vlastimil Petrzela, koji je s momčadi uspio osvojiti Premierligaški kup i dovesti Zenit do srebrnih medalja ruskog prvenstva 2003. godine.
2005. godine Gazprom je otkupio kontrolni udio u FC Zenitu, a to je radikalno promijenilo politiku kluba. U momčadi su se pojavili poznati strani igrači, a novi trener momčadi Dick Advocaat vodio je Zenit do prvog ikad prvenstva u ruskoj Premier ligi.
Advocate se nije mogao nadovezati na uspjeh, a već 2009. FC Zenit je upao u dugotrajnu krizu, nakon čega je uprava kluba odlučila smijeniti glavnog trenera, pozvavši Talijana Luciana Spalettija da ga zamijeni.
Promjena trenera išla je u korist Zenita: 2010. osvojen je ruski kup, a bivši trener Rome dva puta je dovodio Zenit u prvenstvo, čineći klub iz Sankt Peterburga trostrukim prvakom ruske Premier lige.
Međunarodne pobjede
Uspjeh na međunarodnoj sceni u sovjetsko doba zaobišao je Zenit, a sva glavna dostignuća na ovom putu povezana su s imenom Dick Advocaat. Upravo je on vodio FC Zenit do pobjede u Kupu UEFA-e u sezoni 2007/08., Porazivši francuski olimpijski, minhenski Bayern iz Münchena i u finalu - škotski Glasgow Rangers na putu do ovog trofeja.
Za UEFA-in Superkup Zenit se morao boriti s pobjednikom Lige prvaka, strašnim Manchester Unitedom. Međutim, igrači kluba iz Sankt Peterburga nisu oklijevali i pobijedili su super klub iz Engleske rezultatom 2-1, osvojivši željeni trofej.